KS WARTA POZNAŃ
Od lipca 1997 do czerwca 1998 roku Sekcja Piłki Nożnej dysponowała dwoma zespołami seniorskimi (w II lidze oraz w klasie okręgowej) i 12 zespołami młodzieżowymi, występującymi w poszczególnych grupach wiekowych. Ze względu na prestiż oraz występy pierwszego zespołu seniorów II lidze, uwaga działaczy, sympatyków skierowana była na walkę o utrzymanie się w tej klasie rozgrywkowej. Niestety, zespół prowadzony w początkowej fazie przez trenera Mariusza Niewiadomskiego, a następnie przez trenera Andrzeja Żurawskiego, uplasował się na 15. miejscu w tabeli i został zdegradowany do III ligi. W tej drużynie występowali między innymi: Mariusz Bekas, Marcin Godlewski, Czesław Owczarek, Daouda Camara, Jakub Ostrowski, Dariusz Wojciechowski, Artur Topolski, Waldemar Przysiuda, Mariusz Tierling, Wojciech Weiss, Jacek Sommerfeld.
Zespół rezerw występował w klasie okręgowej i zakończył sezon w środku tabeli. Jeśli wyniki drużyn seniorskich nie zadowalały, to osiągnięcia grup młodzieżowych przyniosły pożądane efekty. Pierwszy zespół juniorów w Lidze Międzywojewódzkiej zajął 2. Miejsce i uznać musiał tylko wyższość zespołu poznańskiego Lecha. Drugi zespół juniorów (trener Mieczysław Wojtasik) zdobył 1. miejsce w Lidze Okręgowej, awansując do Ligi Międzywojewódzkiej. Zarząd KS Warta dokonał w tym okresie dwóch transferów definitywnych: Arkadiusz Onyszko przeszedł do Widzewa Łódź, a Maciej Żurawski do Lecha Poznań. Po spadku zespołu do III ligi i zmianie trenera (został nim Leszek Partyński), w rundzie jesiennej sezonu 1998/99 zespół zajmował 2. miejsce w tabeli za Amiką II Wronki. W lutym 1999 roku Zarząd podjął decyzję o kolejnej zmianie szkoleniowca. Przez trzy tygodnie zespół ponownie prowadził Andrzej Żurawski, by w marcu przekazać pracę szkoleniową trenerowi Jarosławowi Szubie. Niestety roszady trenerskie nie przyczyniły się do osiągnięcia sukcesu. W decydującej fazie rozgrywek zespół nie stanowił monolitu, a w kilku meczach można było zauważyć konflikt interesów i brak siły motywacyjnej. Było to zjawisko powiązane bezpośrednio z uchwałą Walnego Zgromadzenia Klubu z maja 1999 roku o zmianie statusu pierwszego zespołu seniorów z zawodowego na amatorski. W czerwcu 1999 roku rozwiązano umowę z trenerem Jarosławem Szubą. We władzach Warty mówiło się o wycofaniu zespołu do V ligi, jednak dzięki stanowczemu sprzeciwowi Zarządu Sekcji Piłki Nożnej podjęto skuteczne kroki w celu pozyskania środków finansowych na pierwszy zespół. Drużyna wystartowała w III lidze. Prowadzenie zespołu powierzono trenerowi Tomaszowi Wichniarkowi. Biorąc pod uwagę fakt drastycznej redukcji środków finansowych oraz odejście 15 podstawowych zawodników, należało się spodziewać obniżenia poziomu sportowego. W wyniku porozumienia z WKP Lech, kadrę zespołu wzmocnili tacy piłkarze jak Radosław Borykin, Marcin Godlewski, Piotr Sołtysiak, Maciej Brauza, Damian Zieniuk. Postawa zespołu po rundzie jesiennej była jednak słaba. Po pięciu meczach zrezygnowano z usług Tomasza Wichniarka a funkcję pierwszego trenera powierzono Antoniemu Pluskocie. Ostatecznie zespół uplasował się na koniec rundy jesiennej na 14. pozycji, a trener Pluskota zrezygnował z prowadzenia drużyny. Seniorski zespół rezerw do czerwca 1999 roku występował w klasie okręgowej, jednak ze względów finansowych nie zgłoszono go do kolejnych rozgrywek.
Struktura szkolenia w grupach młodzieżowych była zgodna z założeniami etapowości tego procesu. SPN posiadała dziewięć zespołów młodzieżowych. Pracą z najmłodszymi piłkarzami zajmowali się trenerzy: Andrzej Żurawski, Damian Salwin, Antoni Pluskota, Mieczysław Wojtasik, Jarosław Ciastowski, Eugeniusz Nowak, Arkadiusz Mikosik, Piotr Tomaszczak, Andrzej Powstański. Drużyny młodzieżowe brały aktywny udział w turniejach piłkarskich. Do spektakularnych sukcesów zaliczyć można wygranie przez drużynę z rocznika 1984 (trener Antoni Pluskota) prestiżowego turnieju w Dobiegniewie w lipcu 1999 roku. Jednym z elementów intensywnego szkolenia były też zorganizowane przez Sekcję obozy szkoleniowe w Lwówku, Błażejewku, Świeradowie, Mielnie i Sierakowie. Na liście talentów Wydziału Szkolenia OZPN pojawili się wychowankowie Warty, m.in. Konrad Majewski, Damian Wdowczyk, Mariusz Piotrowski, Tomasz Zibert, Łukasz Lebioda, Mariusz Niedbała, Mikołaj Wieczorek, Michał Juszczak, Łukasz Szaj czy Maciej Lesiński.
Na początku 2000 roku Zarząd SPN funkcję trenera pierwszego zespołu powierzył Tadeuszowi Łuczakowi, byłemu zawodnikowi i wychowankowi klubu. Dobra praca szkoleniowa, a także zorganizowane z dużym wysiłkiem zgrupowanie w Wągrowcu doprowadziło do osiągnięcia 10. miejsca na koniec sezonu. Wiosną do kadry klubowej doszli m.in. Mateusz Olszowiec, Tomasz Sangowski, Rafał Mielcarek. Przygotowania do rundy jesiennej w sezonie 2000/01 poprzedzone były dokonaniem szczegółowej analizy możliwości kadrowych. Do WKP Lech powrócili zawodnicy uprzednio z niego wypożyczeni. Kadrę wzmocniono Błażejem Jankowskim, Tomaszem Magdziarzem, Bartłomiejem Zalewskim, Tomaszem Parzym, Piotrem Kasperskim, Dariuszem Wojciechowskim, Rafałem Kasalikiem. Wypożyczono też Arkadiusza Miklosika (WKP Lech), Mariusza Tierlinga i Wojciecha Weissa (Patria Buk).
Tak przygotowana dróżyna po rundzie jesiennej zajęła 3. miejsce. W skład zespołu szkoleniowego wchodzili: trener Bogusław Głuszkowski (przygotowanie fizyczne), trener Krzysztof Bladocha (przygotowanie bramkarzy).
W przerwie zimowej kadrę klubową uzupełnili: Jakub Ostrowski, Radosław Borykin, Damian Nawrocik, Przemysław Konicki, Mikołaj Szymański oraz juniorzy: Wojciech Frąckowiak, Mariusz Piotrowski, Mariusz Niedbała, Maciej Lesiński, Sebastian Jankowski, Dariusz Cudny. Z początkiem stycznia do Lechii Gdańsk wypożyczono z kolei Dariusza Wojciechowskiego.
Zespół zajął 2. miejsce w rozgrywkach, niestety ze stratą aż 9 punktów do Arki Gdynia. Z drużyny ubyło wielu czołowych zawodników i w decydujących meczach zabrakło charakteru i doświadczenia boiskowego. Należy dodać, że w rundzie wiosennej został rozpoczęty proces promowania młodych zawodników, zgodnie z założeniami długofalowej polityki personalnej. W świetle pogarszającej się sytuacji finansowej klubu było to rozwiązanie słuszne, choć w bliskiej perspektywie wpłynęło na obniżenie poziomu sportowego.
W roku 2000 z inicjatywy trenera Andrzeja Powstańskiego w sekcji powstała piłkarska drużyna kobiet. W pierwszym oficjalnym meczu zmierzyła się ona z utytułowaną ekipą Medyka Konin. Mecz zakończył się remisem 1:1. Historyczna bramkę dla Warty zdobyła Dominika Skubińska. Po stadium organizacji drużyna wystartowała w rozgrywkach II ligi kobiecej, by później awansować do I ligi. Niestety kłopoty finansowe i bazowe sprawiły, że Sekcja zrezygnowała z prowadzenia tej drużyny.
Po zakończeniu sezonu 2000/2001 nastąpiła zmiana trenera zespołu seniorów. Opiekę szkoleniową powierzono trenerowi Wojciechowi Wąsikiewiczowi, którego asystentem został Krzysztof Pancewicz. Ze względu na uwarunkowania ekonomiczne zrezygnowano z takich piłkarzy, jak Piotr Prabucki (przeszedł do Aluminium Konin), Radosław Borykin i Damian Nawrocik (wrócili do WKP Lech), Jacek Sommerfeld (zrezygnował z gry) i Mikołaj Szymański. Kadrę uzupełnili Michał Juszczak, Mikołaj Przybył (z zespołu juniorów), Piotr Stępniewicz (z BKS Bytyń), Gerard Putz (z Victorii Września) i Kamil Kucia ( z Górnika 09 Mysłowice).
Po obiecującym początku zespół jesienią przechodził kryzys i rundę ukończył na 9. miejscu. W trakcie rundy zespół opuścił Jakub Ostrowski (do Aluminium Konin), co przy kłopotach zdrowotnych Bartosza Zalewskiego, Bartosza Łeszyka i Tomasza Parzego spowodowało regres.
Zespoły młodzieżowe odniosły w roku 2001 kilka znaczących sukcesów. Drużyna juniorów starszych (trener Andrzej Żurawski) zdobyła Puchar Prezesa WZPN, a juniorzy młodsi (trener Antoni Pluskota) zdobyli mistrzostwo Wielkopolski w piłce halowej. Drużyna rocznika 1986 (trener Jarosław Ciastowski) wygrała prestiżowy Dobiegniew Cup 2001. W zespołach młodzieżowych pojawiła się cała plejada młodych, zdolnych piłkarzy powoływanych do kadry Wielkopolski i kadry Polski (Tomasz Bzdęga, Łukasz Lebioda, Łukasz Kubzdyl, Bartosz Kotarski). Ze sztabu trenerskiego odeszli Arkadiusz Miklosik i Andrzej Powstański. Kadrę uzupełniono trenerami Mirosławem Marciniakiem i Sławomirem Kurpiewskim.
W rundzie wiosennej sezonu 2001/2002 kadrę pierwszego zespołu wzmocnił Zbigniew Zakrzewski (który wyrósł na pierwszoplanową postać w Warcie) oraz juniorzy: Damian Ludwiczak, Łukasz Kubzdyl i Tomasz Bzdęga. Drużyna ukończyła rozgrywki na dobrym, 4. miejscu. Kłopoty finansowe sekcji sprawiły, że w lipcu drużynę opuścił trener Wojciech Wąsikiewicz. Zarząd Sekcji powierzył prowadzenie ekipy seniorów jego asystentowi Krzysztofowi Pancewiczowi. Była to jego pierwsza samodzielna praca szkoleniowa na takim szczeblu rozgrywek. Zespół opuścili też m.in. Zbigniew Zakrzewski (powrót do Lecha) i Piotr Tomaszczak (do Obry Kościan). Skład uzupełniono Tomaszem Rybarczykiem, Przemysławem Minge, Janem Stronczyńskim, Przemysławem Otuszewskim (doszedł z zespołu juniorów). Wiosną 2003 roku do drużyny dołączył także Grzegorz Matlak. Te karkołomne roszady kadrowe spowodowane były widmem spadku z III ligi. Po początkowych sukcesach jesienią, w rundzie wiosennej drużyna balansowała na granicy strefy spadkowej. Ostatecznie zajęła 14. miejsce i utrzymała się w III lidze.